מעשי אלימות של אזרחים ישראלים כלפי פלסטינים בשטחים לובשים צורות רבות ושונות, ומגיעים לעיתים לכדי מעשי הרג. מתחילת האינתיפאדה השנייה ועד סוף שנת 2011 הרגו אזרחים ישראלים 50 פלסטינים בשטחים. מדצמבר 1987, אז פרצה האינתיפאדה הראשונה, ועד לפרוץ האינתיפאדה השנייה, הרגו אזרחים ישראלים 115 פלסטינים.

בחלק מהמקרים, ירו ישראלים על פלסטינים כאשר נשקפה סכנה לחייהם, כמו במקרים שבהם ניסו פלסטינים חמושים להיכנס לתוך שטחי התנחלויות. אולם, במקרים רבים אחרים ישראלים הרגו פלסטינים מבלי שהדבר נדרש לצורך הגנה עצמית. למשל, בחלק מהמקרים, אזרחים ישראלים רדפו אחרי פלסטינים שיידו אבנים וירו בגופם. מעשה כזה מנוגד לחלוטין לחוק הפלילי ולהוראות הפתיחה באש החלות על אזרחים.

בשנים האחרונות מבצעים מתנחלים פעולות אלימות תחת הכותרת "תג מחיר". מדובר בפעולות תגמול אלימות המכוונות נגד האוכלוסייה הפלסטינית ונגד כוחות הביטחון הישראליים. מעשי האלימות באים בדרך כלל בתגובה לפעולות של רשויות השלטון הישראלי הנתפסות כפגיעה במפעל ההתנחלות או בעקבות מעשי אלימות של פלסטינים נגד מתנחלים. בצלם תיעד בשנים האחרונות מעשים רבים כאלה, שכללו חסימת כבישים, יידוי אבנים על מכוניות ועל בתים, פלישה לכפרים פלסטיניים ולאדמותיהם, הצתת שדות, עקירת מטעים ופגיעה ברכוש.